Ngoài Công văn số 979/KBNN-KHTH ngày 17/5/2007 về việc thanh toán tiền lương qua tài khoản tiền gửi thanh toán cá nhân, Bộ Tài chính đã ban hành nhiều văn bản liên quan đến nội dung này, cụ thể: Công văn số 16675/BTC-KBNN ngày 6/12/2007 về việc thanh toán cá nhân qua tài khoản cho các đối tượng hưởng lương từ ngân sách nhà nước; Thông tư số 164/2011/TT-BTC ngày 17/11/2011 quy định quản lý thu, chi bằng tiền mặt qua hệ thống Kho bạc Nhà nước (trong đó bao gồm nội dung hướng dẫn thay thế Công văn số 16675/BTC-KBNN); và mới đây nhất là Thông tư số 13/2017/TT-BTC ngày 15/2/2017 của Bộ Tài chính quy định quản lý thu, chi bằng tiền mặt qua KBNN (thay thế Thông tư số 164/2011/TT-BTC). Theo các văn bản này, khi thực hiện việc thanh toán cho các cá nhân thông qua tài khoản thanh toán của đơn vị mở tại ngân hàng theo hợp đồng đã ký với ngân hàng thương mại, thì đơn vị giao dịch tự chịu trách nhiệm về tính chính xác và bảo mật số liệu về danh sách chi trả cá nhân và tự chịu trách nhiệm sự thống nhất về nội dung, số liệu trên hồ sơ, chứng từ gửi Kho bạc Nhà nước với danh sách chi trả cá nhân gửi ngân hàng thương mại nơi mở tài khoản.
Bên cạnh đó, tại tiết c Khoản 1 Điều 6 Thông tư số 13/2017/TT-BTC còn quy định “…trách nhiệm của ngân hàng thương mại trong việc bảo mật thông tin khi thanh toán, chi trả cá nhân qua tài khoản (như tên, số hiệu tài khoản, số tiền thanh toán, tổng số cán bộ); tài khoản thanh toán của đơn vị mở tại ngân hàng thương mại chỉ sử dụng để làm thủ tục trích chuyển các khoản chi vào các tài khoản thanh toán của cá nhân theo từng cán bộ, công chức, viên chức của đơn vị; đơn vị giao dịch không được phép sử dụng tài khoản này cho các mục đích khác.”
Để thanh toán, chi trả cho cán bộ, công chức, viên chức trong đơn vị, đơn vị sử dụng ngân sách làm thủ tục thanh toán gửi KBNN theo quy định tại Thông tư số 161/2012/TT-BTC ngày 02/10/2012 của Bộ Tài chính quy định chế độ kiểm soát, thanh toán các khoản chi NSNN quan KBNN và Thông tư số 39/20116 ngày 1/3/2016 của Bộ Tài chính sửa đổi, bổ sung Thông tư số 161/2012/TT-BTC. Căn cứ đề nghị của đơn vị giao dịch, KBNN kiểm soát, nếu hợp lệ thì làm thủ tục chuyển tiền vào tài khoản thanh toán của đơn vị mở tại ngân hàng thương mại. Ngoài ra, đơn vị không phải thực hiện thủ tục khác tại KBNN để chi trả lương cho cán bộ, công chức, viên chức trong đơn vị.