1. Về việc hoàn thuế giá trị gia tăng hàng hóa nhập khẩu
Căn cứ khoản 1 Điều 60 Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14 quy định về
xử lý số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nộp thừa:
“Người nộp thuế có số tiền
thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt đã nộp lớn hơn số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền
phạt phải nộp thì được bù trừ số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nộp thừa
với số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt còn nợ hoặc trừ vào số tiền thuế,
tiền chậm nộp, tiền phạt phải nộp của lần nộp thuế tiếp theo hoặc được hoàn trả
số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nộp thừa khi người nộp thuế không còn nợ
tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt.
Trường hợp người nộp thuế
đề nghị bù trừ tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nộp thừa với số tiền thuế,
tiền chậm nộp, tiền phạt còn nợ thì không tính tiền chậm nộp tương ứng với
khoản tiền bù trừ trong khoảng thời gian từ ngày phát sinh khoản nộp thừa đến
ngày cơ quan quản lý thuế thực hiện bù trừ.”
Căn cứ Điều 22 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài
chính quy định về tổ chức thu thuế GTGT:
“1. Cơ quan Thuế chịu trách
nhiệm tổ chức thực hiện quản lý thu thuế giá trị gia tăng và hoàn thuế GTGT đối
với cơ sở kinh doanh.
2. Cơ quan Hải quan chịu
trách nhiệm tổ chức thực hiện quản lý thu thuế GTGT đối với hàng hóa nhập khẩu.”
Căn cứ khoản 4 Điều 131 thông tư số 38/2015/TT-BTC ngày 25/3/2015
của Bộ Tài chính được sửa đổi bổ sung tại khoản 64 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC
ngày 20/2/2018 của Bộ Tài chính quy định về thủ tục xử lý tiền thuế, tiền chậm
nộp, tiền phạt nộp thừa: “Việc xử lý tiền
thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt nộp thừa được hoàn thực hiện theo quy định tại
Điều 132 Thông tư này. Số tiền thuế giá trị gia tăng nộp thừa được xử lý đồng
thời với thuế nhập khẩu (nếu có).”
Căn cứ quy định nêu trên, cơ quan hải quan thực hiện hoàn thuế GTGT
nộp thừa đối với hàng hoá nhập khẩu, cơ quan thuế thực hiện hoàn thuế GTGT đối
với cơ sở kinh doanh.
Căn cứ công văn số 1453/TCHQ-TXNK ngày 14/3/2019 quy định:
“Trường hợp doanh nghiệp đã
nộp thuế GTGT đối với hàng nhập khẩu nhưng sau đó phải xuất khẩu trả lại chủ
hàng nước ngoài, tờ khai xuất khẩu đăng ký từ ngày 01/02/2018 thì cơ quan hải
quan thực hiện xử lý tiền thuế GTGT nộp thừa theo đúng quy định.”
Theo đó, đề nghị công ty căn cứ quy định nêu trên và đối chiếu
trường hợp thực tế của doanh nghiệp để thực hiện theo quy định.